WABI (REST) GTOPの仕様 (2009)

service_name	Gtop service_desc_en	GTOP is a database built by the Laboratory of Gene-product Informatics at the National Institute of Genetics consisting of data analyses of proteins identified by various genome projects. This database mainly uses sequence homology analyses and features extensive utilization of information on three-dimensional structures. service_desc_jp	GTOPデータベースは、ゲノムにコードされる全タンパク質の配列データを解析した結果をまとめたデータベースです. 国立遺伝学研究所の 大量遺伝情報研究室 で製作されています. 配列相同性解析を主な手段として、立体構造の情報を積極的に利用していることが特徴です. link_en	http://spock.genes.nig.ac.jp/~genome/gtop.html link_jp	http://spock.genes.nig.ac.jp/~genome/gtop-j.html wsdl	http://xml.nig.ac.jp/wsdl/Gtop.wsdl method_name	getAcList method_desc_en	Get the list of species ID in GTOP, ID in source database, accession number and source database name. method_desc_jp	GTOPの生物種ID、引用したデータベースにおけるID、アクセッション番号、引用したデータベース名の一覧を取得します. result_format_en	Species list in GTOP. The format of the list is tab delimited format and the list contains the following items. Species ID in GTOP, ID in source database, accession number and source database name result_format_jp	GTOPに登録されている生物種の一覧です. タブ区切りフォーマットで以下の項目が記載されます. GTOPの生物種ID、引用したデータベースにおけるID、アクセッション番号、引用したデータベース名の一覧 result_inout_name	文字列型 result_example_start result_example	aaeo0 GIB00014CH01 AE000657 - result_example	aaeo0 GIB00014PL01 AE000667 - result_example	aful0 GIB00012CH01 AE000782 - result_example	anab0 GIB00070PL02 AP003602 - result_example	anab0 GIB00070PL03 AP003603 - result_example	... result_example_end method_name	getMasterInfo method_desc_en	Get result of GTOP analysis from gene ID and species ID. method_desc_jp	遺伝子IDと生物種IDから GTOP の解析結果を取得します. param_start	0 param_print_name	orfID param_inout_name	文字列型 param_desc_en	gene ID param_desc_jp	遺伝子ID param_example_start param_example	thrA param_example_end param_end	0 param_start	1 param_print_name	organism param_inout_name	文字列型 param_desc_en	organism ID param_desc_jp	生物種 ID param_example_start param_example	ecol0 param_example_end param_end	1 result_format_en	Analysis result with master file format result_format_jp	マスターファイル形式のGTOP解析結果 result_inout_name	文字列型 method_name	getOrganismList method_desc_en	Get organism list registered in GTOP database. method_desc_jp	GTOP に登録されている生物種名の一覧を返します. result_format_en	Organism list registered in GTOP database. The first column shows organism ID, the second column shows organism name. result_format_jp	GTOP データベース似登録されている生物種名の一覧がタブ区切りフォーマットで返されます. 第1項目は 生物種 ID、第2項目は生物種名です. result_inout_name	文字列型 result_example_start result_example	aper0	Aeropyrum pernix K1 result_example	aper1	Aeropyrum pernix K1 result_example	saci0	Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 result_example	ssol0	Sulfolobus solfataricus P2 result_example	stok0	Sulfolobus tokodaii str. 7 result_example	paer1	Pyrobaculum aerophilum str. IM2 result_example	aful0	Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 result_example	hmar0	Haloarcula marismortui ATCC 43049 result_example	halo0	Halobacterium sp. NRC-1 result_example	hwal0	Haloquadratum walsbyi DSM 16790 result_example	npha0	Natronomonas pharaonis DSM 2160 result_example	msta0	Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 result_example	mthe0	Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H result_example	mjan0	Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 result_example	mmar0	Methanococcus maripaludis S2 result_example	mhun0	Methanospirillum hungatei JF-1 result_example	mbur0	Methanococcoides burtonii DSM 6242 result_example	mace0	Methanosarcina acetivorans C2A result_example_end