Modeling eyes

Modeling instructions =Tips for eye modelling=

Eyeball has 3 +1 layers of concentric orbital tunics
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 * 1) Layer1 : Sclera - Cornea
 * 2) Layer2 (Uvea) : Choroid   ciliary body   iris
 * 3) Layer3 : neural retina -  ciliary part  iridial part of retina
 * 4) fibrous layer : Hyaloid membrane zonular fibers lens capsule
 * Morphologically, it looks like Hyaloid membrane yarn out threads of zonular fibers to encapsulate the lens.
 * = limbus (angle of iris and cornea); sclerocornear junction (line b/w sclera and cornea)= 5.5 mm from axis
 * = ora serrata (serrated margin of neural retina)= 6 mm arc distant from limbus on the surface.
 * Make(check) the model layer by layer and align the junction.

inspection memo by OK
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 * 1) 視神経がFujieda3.0と重複して登録あり. 　これを見てみると　形状はが変わっただけでなく10mmほど下に並行移動しています.
 * Q:すべてのeye partsは相互にいい感じの位置にあるので全てへ移行移動して3.0に加えることができるんでしょうか？　それとも？？
 * A: 2.0--3.0--4.0(later than 3.0) とほとんどのパーツの位置が少し変化しています. 　Version dependent positional difference in the same parts ですからeye データは　4.0 (bone, brain) とマッチするようです. 　Optic Nerveはeyeとbrainの両方の4.0に含まれるのですが、eyeのoptic nerveを優先させたほうがいいです. 　視交叉は同じ座標ですから. 　非常によくアラインされています.
 * 1) 　EYEモデルとBodyParts3.0モデルの間の座標の関係はどうなっているんでしょうか？　＞＞
 * 2) *解決　メジャーバージョンをまたいでデータを混ぜると不都合がありえる. 部品の間でのcompatibilityのファイルを作るか　それとも4.0をつくってからリリースか？>> compatibility のあるパーツは同じセットにして、セットをまたぐのは可能だがずれがあることを知らせればいい.
 * 3) l と　r はミラーイメージになっている前提でlだけをチェックしました
 * 4) 対応名称間(r.とl.）でデータが鏡像関係でないケース：　(A-r)r. gray_levator palpebrae superioris tendon.obj と　(A-l)l. gray_levator palpebrae superioris tendon.obj.
 * 5) *ファイル名(A-l)のデータはファイル名　(B-r) データの鏡像イメージになっています.
 * 6) *　(A-r)＜r. gray_levator palpebrae superioris tendon＞　の鏡像データが存在しません.
 * 7) * (B-l)110506-eyes_l. check ligament of medial rectus.objという名前のファイルが存在しません.
 * 8) モデル化が途中で終わっている例は        110506-eyes_r. choroid.obj と 110506-eyes_r. choroid 2.obj　です. 　全面と後面に分けてモデル化していますので和をとってchoroidとする計画のはずでしょうか？　とりあえずjoinしたデータを作ってそれをchoroidにします.
 * 9) Ciliary bodyのモデル化も途中のようで、 cilirary process のセットだけしかモデル化されていません. 　Ora Serrata（網膜のマージナルエッジ)からプロセスまでを平滑に結びpars plana とし　ciliaru processの外側に輪状の平滑筋層をつけて両者をpars plicataとすればいいように思います.
 * 10) レンズを固定しているケーブル　zonular fibers of Zinnはその走行をよく教科書で確認して少し工夫するのがいいと思われます. 　pars plana から始まりプロセスを経てレンズの赤道周囲に入ります. 今はこのパーツだけわずかに後ろに動かしておくのがいいと思われます.
 * 11) sclera-cornea retina choroid　すべての層が厚めにできているのでviterous bodyを入れた内腔が小さ目になっています. 無理もないと思いますが何とか次の機会にはすべて正常値を参考に薄くするのが望まれます
 * 12) Orbital septum は　Frontal bone とlevator palpebra の筋膜の間の膜です. 　表層の構造を確認しましょう.

Code 3,2 モデル修正依頼
'''新しくしたモデルは新規のファイル名をつけてムトウさんに送ってもらえればFMA対応表に加えます. ひとつのFMAに新旧のファイルがともに対応していても新しい対応を優先すれば問題なく利用できます. '''

http://farm9.staticflickr.com/8495/8279534789_ddfc80b414_n.jpg
 * REMODEL001:110506-eyes_r. orbital septum.obj: orbital septum は眼窩の骨膜が外に伸びでlevator palpebrae superiorisに融合したものです. 　つまりまぶたの筋肉より外側にあるべきなので　FENEISの断面図で確認してつくり直してください.

http://farm9.staticflickr.com/8498/8279571429_162c6c0bc0_m.jpg
 * REMODEL002: 110506-eyes_r. gray_levator palpebrae superioris tendon.objは形態がcheck ligament of medial rectus のようですのでそのようにリネームします. 　もとの名称levator palpebrae superioris tendonに対応するオブジェクトファイルはどれでしょう？

http://telemedicine.orbis.org/data/1/rec_docs/87_Ch%203%20-%20Summary%20of%20the%20Gross%20Anatomy%20of%20the%20Extraocular%20Muscles,%20p.%2038-51.pdf


 * REMODEL003：Ciliary bodyのモデル化は途中のようで、 cilirary process のセットだけしかモデル化されていません. 　Ora Serrata（網膜の終わり. こぎり状)からプロセスまでを平滑に結びpars plana とし　ciliaru processの外側に輪状の平滑筋層をつけて両者をpars plicataとすればいいように思います.


 * REMODEL004: 110506-eyes_r. lacrimal gland.obj | accessary | FMA59102:Right lacrimal gland |
 * levator がlacrimal glandを貫通しています. glandを上下に分割してそれぞれ Orbital part of gland と palpebral part of gland にしてください.


 * REMODEL005: 110506-eyes_r. cornea.obj | FMA58239:Right cornea | 径が2ミリほど多きいようです. 　結構一定なので 11-12mm　になるのが好ましいです. 膜の厚みも少し厚いのでスペースが窮屈に見えます


 * REMODEL006: 110506-eyes_r. lens.obj | FMA58242:Right lens | Diameter is OK. 径はOKですのでもう少し後ろにつきだした形にして" zonule of Zinn" との関係がよくなると思います.


 * REMODEL007: 110506-eyes_l. vitreous chamber of eyeball.obj| FMA58828:Right vitreous body | make the shape smoothy continuous with zonule of Zinn.


 * REMODEL008: 110506-eyes_r. set of zonular fibers.obj | FMA58839:Suspensory ligament of right lens | レンズを少しzinnに対して前にずらしてレンズの赤道がZINNにうまくかかるようにしてください. 　ZINNの引っ張りでレンズがフラットになる仕組みですから.


 * REMODEL009:110506-eyes_r. retina.obj | 現在のretinaは神経細胞層があるoptic part of retinaのようです. 　その場合でもOraSerrataといわれる末端はもう少し丸いぎざぎざ状にしてください. （ちゃんとchoroidモデルにはその形ができているようです. 　できればもう少し薄く（無理か？）　さらに虹彩のエッジまでの表面に非常にうすいPars ciliaris retinae (ciliary part of retina) が続きますのでできればモデル化してください.

110506-eyes_r. ciliary body.obj | tunic | FMA58483:Right corona ciliaris | ciliary body =corona ciliaris (pars plicata) + cobiculus ciliaris (pars plana) | 2
 * 110506-eyes_l. ciliary body.obj | tunic | FMA58484:Left corona ciliaris | ciliary body =corona ciliaris (pars plicata) + cobiculus ciliaris (pars plana) | 2
 * 110506-eyes_l. gray_common tendinous ring.obj | ligament | FMA49073:Left common tendinous ring | shape should be oval to accommodate III and VI from superior orbital fissure | 2


 * 110506-eyes_l. sclera.obj | tunic | FMA58272Left sclera | radius(26mm vertical) is a bit bigger than normal (23mm Vertical); Wall too thick | 2

110506-eyes_r. set of long ciliary nerves.obj | nerve | FMA82734:Right long ciliary nerve | should be a pair (sup and inf) | 2 http://www.bartleby.com/107/Images/large/image875.gif
 * 110506-eyes_l. set of long ciliary nerves.obj | nerve | FMA82735:Left long ciliary nerve | should be a pair (sup and inf) | 2

'''新しくしたモデルは新規のファイル名をつけてムトウさんに送ってもらえればFMA対応表に加えます. ひとつのFMAに新旧のファイルがともに対応していても新しい対応を優先すれば問題なく利用できます. '''