Replacing SuperComp 2012

新スパコン構築風景| DDBJスパコン仕様を考える|政府調達の精神 | 各種解析サービスとFTPダウンロードの利用統計 | 遺伝研のネットワーク | 2011遺伝研ネットワーク刷新事業 | A Load to Replace|Rules and Policies for SC =スパコン更新準備　施設編=


 * ５年ぶりのマシンの更新が今年度末です.
 * パワー計算に依存度を強める大学バイオ系共同利用機関としては同規模予算で相当の能力アップが必要です.
 * さらに高濃度化する計算資源の電力消費も極力抑えなければなりません.
 * いままで気に留められていなかった研究所全体の電力消費も分析に着手し必要な電力確保にかからなければなりません. （参考遺伝研の電力使用量推移：DDBJの節電対応）
 * 仕様についてはDDBJスパコン仕様を考えるで小笠原が報告しますが、
 * 政府調達の精神に従い可能な限り技術以外の制約を取り除き技術競争下で更新入札が進むように2011年に行った更新準備につて経緯を記します. 16:59, 15 September 2011 (JST)

2011年初頭
 * DDBJにはスパコン棟と呼ばれる３階建てのビルがあります. (下図)
 * １Ｆは６室に区切られエンジニア室とバッテリー室が、２階も６室ありエンジニア室と電源、３Ｆが計算機室.
 * ２階には稼働中や転用中停止中おりまぜ１０年分のプロジェクト関係のサーバー群が置かれ満杯.
 * サービスを中断せずに大規模にリース機器の入れ替えを行うのは困難.
 * 機器運用とネット管理のエンジニアの居室が計算機棟の１Ｆ２ＦとＤＤＢＪ棟の２Ｆに離れて存在.
 * ３階のスパコン室はフロア内に仕切り壁で入退室管理

SadW_jYU17k 
 * 2007年導入のスパコン計算機群（スパコン棟3F）撮影2011-09-15 移行用temporaly serverをネットにつないでくれてるシステム管理Ｇの星さんがラックから登場します.

http://www.youtube.com/watch?v=SadW_jYU17k 

アイデア 費用 不要機器廃棄　30万円 計算機棟２階フロア壁撤去内装破棄空調配管破棄　500万円 ＤＤＢＪ棟会議室撤去　エンジニアオフィス新設 柏高木研より不要什器寄付+什器内装200万円 消火設備　遺伝研 耐震補強 は必要なし 壁内装工事　80万円 扉と認証システム　来年度 結露対策窓２重化　来年度
 * 1) スパコン棟内に空きスペースを設けて維持し、繰り返す新規機器の搬入と旧機器の搬出作業に将来にわたって干渉しないためのバッファースペースを作る
 * 2) アノテーターの居室と同じＤＤＢＪ棟の２Ｆに居室を新設し相互連絡が自然に行われる環境に集合してもらう
 * 3) DDBJ棟から計算機棟への渡り廊下の末端で入退室管理用の扉を設け計算機棟一階の入り口は施錠する
 * 4) 廊下で連結した二つのビルの2FにDDBJ機能を集中させる




 * Replace2011-02-08 Dispose machine trashes accumulated for the last 10 years. Starting from minus!  http://farm7.static.flickr.com/6172/6146133143_a8f99d1697.jpg

http://farm7.static.flickr.com/6061/6146133807_b57577893d.jpg movie
 * Replace2011-02-18 Emptied 2nd floor of comp bldg.

http://farm7.static.flickr.com/6204/6146135415_5f3b325d97.jpg http://farm7.static.flickr.com/6065/6146683186_de682c729f.jpg
 * Accident2011-03-17after the EQ, service shift under rolling blackout

http://farm7.static.flickr.com/6174/6146137229_56fdca0cab.jpg
 * Accident2011-06-27Precise temperature measurement for power saving in comp bldg. Dr.Yamada@takagi lab (seen here) led temperature project in NIG-wide.

http://farm7.static.flickr.com/6205/6146137797_0388336430.jpg Qp12Au9U53o http://www.youtube.com/watch?v=Qp12Au9U53o http://farm7.static.flickr.com/6171/6149044601_558af22ffd.jpg http://farm7.static.flickr.com/6201/6149019465_324b7cabe7.jpg
 * Replace2011-08-10<Note> complete enucleation of whole 2nd floor of comp bldg finished.
 * <DDBJevent>Replace<Date>2011-09-14<Note> Software transferring team at work in new SE room that holds all the SEs in DDBj in one room. This locates next to the DDBJ annotator room separated by a hallway.


 * <DDBJevent>Replace<Date>2011-09-14<Note>Temporaly servers set for minimum services that will bridge the possible gap.

=サービス移行用の事業費購入＋スパコン早期導入 3F= http://farm7.static.flickr.com/6167/6146686718_dfaa11133f.jpg


 * DDBJスパコン移行作業時期に使用するテンポラリサーバ

http://farm8.staticflickr.com/7031/6809800901_11bfe940b6.jpg
 * 現スパコンからデータを抜出すために３階に早期導入したDisk 250T x 2

=新スパコン構築風景　2F = 新スパコン構築風景

=Eternusからの退避= GIB については 2/15 の停止後に一通りバックアップを取るとのことでした. WABI については私のほうでバックアップを取っておきます.
 * 日付: 2012年2月6日18:39件名: Re: Fw: MiGAPのデータ 菅原先生 重元です.
 * 1) *GTPS, GBIF, biobase については買い取りサーバで稼働していますので、対象外です.
 * 1) MiGAP:??